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जैवसूचना विज्ञान में अनुक्रम विश्लेषण का प्रमुख उद्देश्य विभिन्न जैविक अनुक्रमों, विशेषकर प्रोटीन अनुक्रमों, के बीच समानता और विकासात्मक संबंधों की पहचान करना है। प्रोटीन अनुक्रमों की तुलना करते समय यह समझना आवश्यक होता है कि एक अमीनो अम्ल के स्थान पर दूसरा अमीनो अम्ल कितनी संभावना से आ सकता है और ऐसा परिवर्तन जैविक रूप से कितना स्वीकार्य है। इसी आवश्यकता को पूरा करने के लिए अमीनो अम्ल प्रतिस्थापन मैट्रिक्स का उपयोग किया जाता है, जिनमें PAM और BLOSUM मैट्रिक्स सबसे अधिक प्रचलित हैं। PAM (Point Accepted Mutation) मैट्रिक्स का निर्माण मार्गरेट डेहॉफ द्वारा किया गया था। इसकी संरचना निकट संबंधी प्रोटीन अनुक्रमों के अध्ययन पर आधारित है, जिनमें बहुत कम विकासात्मक परिवर्तन हुए होते हैं। PAM मैट्रिक्स _________ _________ _______ _____ ______ _________ ____ __________.
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