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युग्म–वार और बहु–अनुक्रम संरेखण जैव सूचना विज्ञान के महत्वपूर्ण उपकरण हैं, जिनका उपयोग जैविक अनुक्रमों (DNA, RNA, या प्रोटीन) के बीच समानताएँ और भिन्नताएँ पहचानने के लिए किया जाता है। ये विधियाँ जैविक डेटा के विश्लेषण में सहायक होती हैं और इनका उपयोग आनुवंशिक विविधताओं, संरचनात्मक विश्लेषण और विकासात्मक शोध में किया जाता है। युग्म–वार संरेखण (Pairwise Alignment) में दो अनुक्रमों की तुलना की जाती है। इसका उद्देश्य यह पहचानना है कि दोनों अनुक्रमों में कितनी समानताएँ हैं और कितनी भिन्नताएँ। इस प्रक्रिया में, अनुक्रमों को इस तरह से संरेखित किया जाता है कि अधिकतम समानताएँ मिल सकें। युग्म–वार संरेखण को दो प्रकारों में विभाजित किया जा सकता है: 1. स्थानीय संरेखण (Local Alignment): इसमें केवल __________ _______ ___ ____ _______ ____ _____ _________ ___ _______ ______.
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