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मास स्पेक्ट्रोमेट्री एक विश्लेषणात्मक तकनीक है जिसका उपयोग अणुओं का मास (भार) और संरचना निर्धारित करने के लिए किया जाता है। यह प्रक्रिया प्रोटीन, पेप्टाइड्स और अन्य जैविक अणुओं के विश्लेषण में विशेष रूप से उपयोगी है। इसका कार्य सिद्धांत कई चरणों में बंटा होता है:

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