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प्यूरीन न्यूक्लियोटाइड संश्लेषण का नियंत्रण कई स्तरों पर होता है, जिससे यह सुनिश्चित किया जा सकता है कि कोशिकाओं में इनका सही स्तर बना रहे। मुख्य रूप से, यह नियंत्रण जीन अभिव्यक्ति, एंजाइम गतिविधि और सब्सट्रेट की उपलब्धता द्वारा होता है। 

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