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ई. कोलाई में पुनर्संयोजित प्रोटीन का उत्पादन कई चुनौतियों के साथ जुड़ा होता है। सबसे बड़ी चुनौती यह है कि प्रोटीन अक्सर गलत फोल्डिंग या इन्सोल्यूबल फॉर्म में जमा हो जाता है, जिसे inclusion bodies कहा जाता है। इसके अलावा, ई. कोलाई में प्रोटीन पर post-translational modifications जैसे glycosylation नहीं हो पाती, जिससे कुछ प्रोटीन अपनी जैविक _______ ___ _____ __________ ______ ___ _____ ______.
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